Breve resumo da scriptagem do meu projeto de mestrado:

Sempre quis mostrar a estrutura do meu projeto de Mestrado em Biologia Molecular. Trabalhei com bioinformática, simulando uma hipótese sobre o comportamento de uma proteína no computador por meio da metodologia de Dinâmica Molecular Clássica. O objetivo da simulação de DM é estudar a dinâmica de um determinado sistema. Como realizamos um estudo in silico, precisamos adequar o ambiente da nossa estrutura o mais próximo possível do sistema real. Assim, a metodologia central consistiu em criar scripts e ajustar os parâmetros corretos para que as funções funcionassem e simulassem adequadamente o sistema biológico. ou tentar dissecar as etapas e deixar um conjunto de scripts utilizados para executar a DM através do software Amber. O software funciona chamando funções estatísticas e biofísicas para testar um modelo/problema, e ajustar seus parâmetros foi uma parte importante do trabalho. Espero que esse material possa, pelo menos, trazer um pouco de esclarecimento sobre como funciona um software operado via terminal e o próprio processo de dinâmica molecular.